In 1028 bevestigde keizer Koenraad in een oorkonde de gift - door de bisschoppen Ansfridus en Adelbold - van het dorp Bergan aan de abdij van St. Paulus te Utrecht. Dit is de oudste, erkende, schriftelijke vermelding van Hillegersberg.
De eerste bewoners moeten zich al eeuwen eerder in de streek hebben gevestigd. Bij opgravingen in de kerkheuvel zijn scherven aangetroffen van aardewerk dat waarschijnlijk afkomstig is uit de pre-Romeinse tijd.
Van de middeleeuwse geschiedenis van Hillegersberg is weinig met zekerheid bekend. Zeker is dat Rotterdam in het bezit kwam van de ambachtsheerlijkheid. Wanneer dat precies gebeurde is onduidelijk. Tot 1811 omvatte het ambacht Hillegersberg en Rotteban ook Bergschenhoek, hetwelk in dat jaar een zelfstandige gemeente werd.
In 1941 ging Hillegersberg, samen met het buurtschap Rotteban, op in Rotterdam.